relax

Il s'agit d'une version de correction mineure qui résout un problème important, introduit quelque part dans le dernier que peu relax communiqués, par lequel relaxation données manquantes ne sont pas manipulé correctement dans une analyse sans modèle. Un certain nombre d'autres petits bugs ont également été corrigé.

Cette version a résolu un certain nombre de questions, y compris les questions de Python 3, APB et structure de gestion et les données manquantes de relaxation causant des analyses sans modèle à l'échec. Mise à niveau vers la nouvelle version est fortement recommandée.

Il s'agit d'une version majeure de fonctionnalité et de correction qui marque l'achèvement de la mise en œuvre de l'analyse du modèle N-État. Le modèle N-état permet aux structures simples ou des ensembles de structures statiques pour être analysées et comparées à l'aide des couplages dipolaires résiduels (CDR), des mouvements pseudo-contact (SCP) et des contraintes de distance par l'intermédiaire de réseaux d'excellence. En plus des tenseurs d'alignement, les populations ou les probabilités de chaque État peuvent être optimisées, ainsi que la position du centre paramagnétique lors de la SCP est utilisés.

C'est la deuxième version de la GUI de relax et est une réécriture du code principal. Il est maintenant fonctionnel sur GNU/Linux, Mac OS X et MS Windows. En plus de nombreuses corrections de bogues, il y a des améliorations à la théorie de l'ordre trame, N-État analyse de modèle, gestion des valeurs de PC et de la RDC, un certain nombre de nouvelles fonctions de l'utilisateur pour superposition, déplacement et la création de la structure et de visualisation de résultat sans modèle dans PyMOL et une refonte des auto-analyses d'avoir toutes les données entrées préchargées dans un tuyau de données relax pour le soutien des molécules organiques non protéique dans l'auto-analyse dauvergne_protocol.

Ceci est une version caractéristique majeure. Elle ajoute la possibilité d'exécuter détendre sur des clusters ou des grilles d'ordinateurs via le protocole MPI. Cette fusionne à Gary Thompson multi-processeurs branche, qui a débuté tout le chemin de retour en 2007. Le "multi" paquet introduit deux tissus processeur, la norme mono-processeur mode et le mode d'mpi4py utilisant le protocole MPI avec Python. L'analyse de code sans modèle a été parallélisé pour profiter des modes multi-processeurs, de manière significative accélérer les calculs sur des clusters avec une efficacité d'échelle quasi parfaite.