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Description du projet

relax is a program designed for the study of the dynamics of proteins and other macromolecules though the analysis of experimental NMR data. It supports exponential curve fitting for the calculation of the R1 and R2 relaxation rates, calculation of the NOE, reduced spectral density mapping, the Lipari and Szabo model-free analysis, study of domain motions via the N-state model (or ensemble analysis) and frame order dynamics theories using anisotropic NMR parameters such as RDCs and PCSs, the investigation of stereochemistry in dynamic ensembles, and the analysis of relaxation dispersion.

Système requise

System requirement is not defined
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2011-08-13 06:34
1.3.11

Ceci est une version caractéristique majeure, et tous les utilisateurs sont recommandons de mettre à niveau. Les principales caractéristiques comprennent l'intégration de la détente et le BMRB via la lecture et l'écriture de fichiers au format BMRB RMN-STAR pour les modèles sans analyses, le soutien à la lecture des fichiers XYZ structure 3D utilisé en chimie organique, d'importantes améliorations de l'interface, et un meilleur soutien pour la Dynamique des Protéines Bruker Centre (PDC) des fichiers. En outre, un grand nombre de bogues ont été résolus. Tous ensemble, c'est une grande libération composé d'un peu moins de 2000 changements individuels.
Tags: major feature release, Major bugfixes
This is a major feature release, and all users are recommend to upgrade. The major features include the integration of relax and the BMRB via the reading and writing of the BMRB NMR-STAR format files for model-free analyses, support for reading the XYZ 3D structure files used in organic chemistry, significant GUI improvements, and better support for the Bruker Protein Dynamics Centre (PDC) files. In addition a large number of bugs have been resolved. All together, this is a large release consisting of just under 2000 individual changes.

2011-02-19 07:30
1.3.10.

Ceci est un communiqué de fonctionnalité majeure qui introduit le support de la lecture de Bruker Dynamique des Protéines Centre (PDC) des fichiers. Elle corrige aussi un bug dans les valeurs du modèle N-état facteur Q lorsqu'il est exécuté en combinaison avec des simulations de Monte Carlo pour l'analyse des erreurs.
Tags: Major feature enhancements, Minor bugfixes
This is a major feature release that introduces support from reading Bruker Protein Dynamics Centre (PDC) files. It also fixes a bug in the N-state model Q factor values when run in combination with Monte Carlo simulations for error analysis.

2011-01-27 18:03
1.3.9

Ceci est une version caractéristique majeure qui introduit une nouvelle interface utilisateur graphique. Cette interface permet d'accéder facilement à un sous-ensemble de détendre les caractéristiques - la relaxation R1 et R2 taux d'ajustement de courbe, les calculs de NOE, et l'analyse entièrement automatique, sans modèle du module dauvergne_protocol (d'Auvergne et Gooley, 2008, JBNMR, 40, 121).
Tags: major feature addition
This is a major feature release which introduces a new graphical user interface. This GUI provides easy access to a subset of relax's features - the R1 and R2 relaxation rate curve-fitting, NOE calculations, and the fully automatic model-free analysis of the dauvergne_protocol module (d'Auvergne and Gooley, 2008, JBNMR, 40, 121).

2011-01-21 07:29
1.3.8

Il s'agit d'une version de maintenance mineure en vue de la fusion imminente de relaxGUI. Les nouvelles fonctionnalités comprennent un exemple de script pour créer des fichiers CSV à partir des résultats sans modèle à l'importation dans les tableurs, les tests système étendu de tous les modèles sans modèle, des correctifs pour un test du système sur 32-bit GNU / Linux, et un correctif pour l'exécution de scripts avec certaines versions de Python.
This is a minor bugfix release in preparation for the impending merger of relaxGUI. New features include a sample script for creating CSV files from model-free results for import into spreadsheet programs, extensive system testing of all model-free models, fixes for a system test on 32-bit GNU/Linux, and a fix for running scripts with certain versions of Python.

2011-01-11 07:01
1.3.7

Il s'agit d'une version de maintenance majeure: tous les utilisateurs, sans modèle de relaxation version 1.3.6 doivent mettre à niveau vers cette version. Le bug fatal est que le tenseur de diffusion prolate, quand initialisé avec Da mis à zéro, sera converti en un tenseur aplatie. D'autres bugs fixés comprennent le soutien pour l'intégration de volume avec des spectres reproduits, la dépendance scipy actuellement facultative, 32-bit GNU / Linux fixe suite de tests, et un meilleur support pour la lecture des fichiers ancienne version 1.2.x résultats. Une autre caractéristique est que la détente packages / modules peuvent désormais être importés et utilisés en dehors de vous détendre.
Tags: Major bugfixes
This is a major bugfix release: all model-free users of relax version 1.3.6 must upgrade to this version. The fatal bug is that the prolate diffusion tensor, when initialized with Da set to zero, will be converted to an oblate tensor. Other bugs fixed include support for volume integration together with replicated spectra, the scipy dependency now being optional, 32-bit GNU/Linux test suite fixes, and better support for the reading of old version 1.2.x results files. An additional feature is that the relax packages/modules can now be imported and used outside of relax.

Project Resources