kawa-k
kawa-****@mail*****
2008年 3月 10日 (月) 16:18:42 JST
Ｋｎｏｂ−ｆｒｉｅｎｄｓ 関係者 様 knob-****@lists***** 2008-3-10 Ｒｅ：proxy設定のある環境からのＫｎｏｂ４．０利用法（問い合わせ） Bioinfomaticsに関心のある生命系教員です。２００８年２月末に出版された 「オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス」オープンバイオ研究会編（東京電機大学出版局 ISBN 978-4-501-62260-2）を早 速購入しKnob 4.0の付属live DVDに収録されているプログラムを走らせています。 %%%%%%%% 操作で１つ困った点がありご教示をお願いいたします。%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% live DVDでKnob 4.0を動かすのに、所属大学のproxy設定のあるインターネット端末 からですと、まったくデータにアクセスできません。たとえばｐ２３の "$ infoseq refseq:NM_138712"を shell-konsoleから入力しても２−３分後に エラーとかtime-outなどが表示されます。 この時、Knob 4.0のコントロールセンターメニュー内のプロキシ設定とweb-ブラウザ（Iceweasel）の編集メニュー内のプロキシ設定は適正にしておりweb sitesはどれも閲覧可能です。 原因は”shell-konsoleのプロキシ設定が適正でないためか（？）”と思い、いろいろ検索したのですが結局わからず改善しません。（そもそもshell-konsoleになんらかのプロキシ対応の設定が必要ですか？） ちなみにproxy設定のないインターネット端末からはプロキシ設定など不要で、簡単にデータがとれます。たとえば「オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス」ｐ２３の "$ infoseqrefseq:NM_138712"など２０秒以内に同書記載の結果をダウンロードしてきます。今はもっぱら大学外でKnob 4.0を使用しています。何かアドバイスかご助言などいただけますでしょうか？お忙しい折、恐縮ですがよろしくお願いいたします。河 和善東北大学医学系研究科kawa-****@mail*****
