Molby - A Molecular Modeling Software

Fork

Version 1.0（正式版）を公開しました。

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"About" ダイアログの表示を改良。

ダブルクリックで構造式を入力する時、直前の入力を覚えておくようにした。

構造式で NO2, SO（スルホニル基）, SO3H を認識するようにした。

Create GAMESS にオプションを追加。

等高面の表示がおかしかったので修正。

Create MO Surface: デフォルトの不透明度を 0.8 から 0.6 に変更。

電子密度が非常に小さい (1e-100未満) 時に create cube が失敗していたので修正。

Show MO Surface ダイアログに create cube ボタンを追加。

複数構造を持つ CIF ファイルが開けるようにした（複数のドキュメントが開く）

Mac版

PowerPC と 32 bit Intel はサポートしない。64 bit Intel のみ。動作要件は 10.6 以上とする。

アプリケーションアイコンに log ファイルをドラッグ＆ドロップしたときの不安定さを改善。

スタートアップ時に、前回のファイルを読み込もうとしてクラッシュしていたのを修正。

修正済みのドキュメントファイルをクローズボックスで閉じる時にクラッシュしていたのを修正。

Windows版

インストーラで 32bit/64bit の両方がインストールできるようにした（OS の仕様に合わせる）。zip アーカイブは 32bit と 64bit を別に用意する。

Ruby ダイアログでテキストフィールドを使った時にエラーが出ていたのを修正。

組み込みRuby

モーダルダイアログがときどきクラッシュしていたのを修正。

from_dump が機能していなかったので修正。

エラーダイアログ表示中はタイマー割り込みを止めるようにした。

create_graphic を :poly で使用した時の法線ベクトルの取り扱いを改善。

ドキュメントを整備。

export_graphic コマンドで画像の横・縦サイズを指定できるようにした。

cubegen で mo=0 を可能にした。これは「任意のベクトル」を意味する。

Version 1.0 (first official release) is out.

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About dialog is improved.

On double-clicking and entering formula, the last input string is remembered and shown as the default input

NO2, SO (sulfonyl) and SO3H (sulfonic acid) are now recognized as known fragments.

More options in Create GAMESS dialog.

Handling of the surface normals was incomplete. Fixed.

Create MO Surface: default opacity is set to 0.8 instead of 0.6.

Creating cube file was failing when very small electron density (<1e-100) appeared. Fixed.

Show MO surface dialog now has 'Create Cube' button.

A CIF file with multiple structures now can be processed (multiple documents are opened in this case)

Mac

PowerPC and 32-bit intel are no longer supported. The binary is 64-bit Intel only. Minimum requirement is now 10.6.

Fix unstable behavior on drag-and-dropping a log file on the application icon.

On startup, re-opening the last opened documents was causing crash. Fixed.

Fixed crash on closing a modified window with a close box.

Windows

The installer now can install 64bit or 32bit version according to the OS architecture.

Fix assertion failure on using text field in Ruby dialog.

Ruby

Modal dialog caused crash sometimes on activation. Fixed (hopefully)

from_dump was not working because String#each is no longer implemented. Fixed.

Stop timer before showing error dialog

In create_graphic with :poly argument, handling of the normal vectors is improved.

Document for the Ruby extension is updated.

export_graphic now allows specification of the width and height of the captured image.

cubegen now accepts mo=0, which means 'arbitrary vector'