Bioperl is set of Perl Modules for bioinformatics. It contains objects for Sequences, features on Sequences, and other important bioinformatics attributes.
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De nombreux correctifs et améliorations ont été apportées, notamment une aide pour analyser les dernières modifications apportées au format texte et Paramédical BLAST, PAML 3,15 soutien, une taxonomie (Bio:: Espèces) remise en état, une bio:: Plan de révision, une bio:: SearchIO SpeedUp, l'introduction de une installation Build.PL système, et corrections de quelques fuites de mémoire dans Bio:: Arbre. Cette version requiert Perl Version 5.6.1 ou ultérieure.
Tags:
Development, Major feature enhancements
Many bugfixes and enhancements were made, including support for parsing the latest NCBI BLAST text format changes, PAML 3.15 support, a Taxonomy (Bio::Species) overhaul, a Bio::Map overhaul, a Bio::SearchIO speedup, the introduction of a Build.PL installation system, and fixes for some memory leaks in Bio::Tree. This version requires Perl 5.6.1 or later.
Cette version corrige brisé le code de la version 1.5.0, traite des changements Paramédical RemoteBlast, ajoute une meilleure analyse BLAST, et respecte le 1.4.0 de l'API.
Tags:
Development, Minor bugfixes
This release fixes broken code in the 1.5.0 release, deals with NCBI
RemoteBlast changes, adds better BLAST parsing, and respects the 1.4.0
API.
Cette version inclut plusieurs nouveaux modules et à un nettoyage de code puisque la branche 1.4.0. C'est le code initial qui mènera à la version 1.6 branche stable.
Tags:
Development, Major feature enhancements
This release includes several new modules and some
code cleanup since the 1.4.0 branch. It is the
initial code that will lead to the 1.6 stable
branch release.
