Kazuharu Arakawa
gaou****@sfc*****
2007年 6月 6日 (水) 23:11:45 JST
g.
v.1.6.8リリースしました。
変更点は以下の通りです。G-language Shell周りの実装・最適化は
だいたいこれで終了しました。
重要な変更として、
1. new G()の"without annotation"オプションと"long sequence"
オプションを削除しました。あまり誰も使っていないし、
1.6.4のキャッシュ機能で大幅にシステム自体が早くなったので
不要だと判断しました。
2. EMBLパーサにいくつか深刻なバグがありました。
multiple locusで、長いjoin行を持つEMBLファイルを扱って
いた場合（若干特殊な場合ではありますが）、正しくファイルを
読み込めていなかった可能性が高いです。以上の条件に当てはまる
解析は大変申し訳ありませんが追試していただく必要があります。
1.6.8 2007.06.06
-clened up the codes of G-language Shell
-logging features are moved to G::Shell::Log
logging now works quite nicely
-modified the loading message
- '-h' option shows help message for G command
-removed "without annotation" option for new G()
-removed "long sequence" option for new G()
-fixed a bug in EMBL parser (multiple-locus, join)
Kazuharu Arakawa, Ph.D.
Institute for Advanced Biosciences, Keio University
252-8520 Japan Tel/Fax: +81-466-47-5099