バージョン 0.6.4 を公開しました。
- bond/angle/dihedral/improper の属性テーブルを開くと、分子力学パラメータを検索するようにした（ただし、結合情報から angle/dihedral テーブルの再構成はやらない。これは MM/MD ウィンドウを開いたときに起きる）
- 属性テーブルに単位格子を表示できるようにした。
- "Show Graphite" コマンドが間違った C-C 結合距離を使っていたので修正。正しくは 1.42Å。
- 最適平面計算を実装（Script メニューの Best-fit Plane）
- リビジョン番号を About ダイアログに表示するようにした。
- 単位格子の最適化機能を実装（まだ実験的）
- 原子当たりの結合数の上限 (12) を撤廃した。
- Ruby: Dialog#filter_kit を実装。使い方がドキュメントの付録に書かれている。
- Ruby: LAMatrix#svd (singular value decomposition) を実装。
- Ruby: bond_par, angle_par, dihedral_par, improper_par, vdw_par メソッドを Molecule から MDArena に移した。
- その他多くのバグ修正（ChangeLog 参照）
Version 0.6.4 is out.
- Opening bond/angle/dihedral/improper table now triggers searching MD parameters (but not rebuilding angle/dihedral/improper tables).
- Property table can now list the unit cell parameters.
- "Show Graphite" command was using _very_ wrong C-C bond length. Now it uses correct length (1.42 angstrom).
- Best-fit plane calculations are implemented.
- The revision number is displayed in the about dialog.
- Cell parameter minimization is implemented (still experimental).
- The restriction on the number of bonds (12) is removed.
- Ruby: Dialog#filter_kit is implemented. The how-to is described in the document (appendix).
- Ruby: LAMatrix#svd (singular value decomposition) was implemented.
- Ruby: The methods bond_par, angle_par, dihedral_par, improper_par, vdw_par are moved from Molecule to MDArena.
- Bug fixes (see the ChangeLog)
Fork