AGM実行結果に対する疑問点について (MUSASHI-users 475) - MUSASHI

はじめまして、Handaと申します。

最近、MUSASHIのことを知り、
AGMについて興味が沸いたので、
ちょこちょこと使ってみました。

サンプルデータを動かしたところ、
3点ほど疑問点が出てきましたので、
どなたかにお答えしていただければと思いまして、投稿いたします。

サンプルデータは、下記更新情報より取得しました。
http://musashi.sourceforge.jp/diff103to104/change.html

化合物、グラフマイニングともに知識が充分ではないので、
勘違いでしたら、その旨ご指摘いただければ幸いです。


疑問点1：サンプルデータの結果について
  agmを実行した結果がグラフ頂点IDのリストになっていますが、
  この結果は、説明にあるように、
  『発ガン性を引き起こす部分分子構造が含まれている可能性が高い』
  構造なのでしょうか？
  それとも、あくまでもサンプルなのでしょうか？

疑問点2：サンプルデータを編集した結果について1
  agmを実行した結果を原子のリストにするべく、
  サンプルデータのVertexLabelの付け替え等の試行しましたが、
  最終的に、VertexLabelの数をひとつにする事で、
  頂点IDのリストから（>>）原子のリストになりました。
  マイニング対象のfieldを指定することは出来ないのでしょうか？

疑問点3：サンプルデータを編集した結果について2
  上記のように頂点のfieldを原子ひとつにして実行した結果、
  ======
    <Graph graphId="27" miningStatus="induced" support="0.833">
      <Vertex vertexId="1" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="C"/>
      </Vertex>
      <Vertex vertexId="2" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="C"/>
      </Vertex>
      <Vertex vertexId="3" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="Cl"/>
      </Vertex>
      <Edge edgeId="1" edgeType="undirected" dimension="1" 
bgnVertexId="1" endVertexId="2">
        <EdgeLabel field="bondtype" value="s"/>
      </Edge>
      <Edge edgeId="2" edgeType="undirected" dimension="1" 
bgnVertexId="2" endVertexId="3">
        <EdgeLabel field="bondtype" value="s"/>
      </Edge>
    </Graph>
  ======
  
  このようにすべての頂点が連結している結果とともに、
  
  ======
    <Graph graphId="32" miningStatus="induced" support="0.667">
      <Vertex vertexId="1" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="C"/>
      </Vertex>
      <Vertex vertexId="2" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="C"/>
      </Vertex>
      <Vertex vertexId="3" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="C"/>
      </Vertex>
      <Vertex vertexId="4" dimension="1">
        <VertexLabel field="atomy" value="Cl"/>
      </Vertex>
      <Edge edgeId="1" edgeType="undirected" dimension="1" 
bgnVertexId="3" endVertexId="4">
        <EdgeLabel field="bondtype" value="s"/>
      </Edge>
    </Graph>
 ======
 
 このように一部、または全ての頂点に連結が無いという
 結果がでてきました。
 
 このような結果は、
 『グラフ理論的には正しく、化合物的に正しくない』
 という解釈でよろしいのでしょうか？
 

なにぶん、無知なのでよくわかっていないのですが、
どうかよろしくお願いいたします。


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Handa
shink****@pb3*****

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