調査の結果、makefileの不備であることが分かり、Revision46で対策しました。 (Verilogシミュレーションでも同様の問題がありましたが、それもいっしょに対策してあります) この問題を解消するために取れる選択は ・SVNリポジトリからRevision46以降のtrunk.tar.gzを入手する。 ・Version0003がリリースされるまで待つ。 です。 この問題を回避するためには、 ・make isesimproj-vhdl の前に、make iseproj-vhdl ・make isesimproj-verilog の前に、make isesimproj-verilog を行ってください。